Connect with us

Publicado

on

En el mundo de la bioinformática y la biología de sistemas, la base de datos STRING se ha consolidado como una herramienta esencial para analizar interacciones proteína-proteína y asociaciones funcionales. Actualizada en 2025 con la versión 12.5, STRING integra datos de experimentos, predicciones computacionales y literatura científica, facilitando el descubrimiento de redes proteicas con direccionalidad. Si buscas entender para qué se usa STRING, sus aplicaciones en investigación reciente o cómo contactar al equipo, esta guía SEO-optimizada te lo explica paso a paso.

¿Para Qué se Usa la Base de Datos STRING?

STRING es un recurso gratuito y accesible que compila, puntúa e integra información sobre asociaciones proteína-proteína, incluyendo interacciones directas (físicas) e indirectas (funcionales). Su objetivo principal es ayudar a los investigadores a mapear redes complejas de proteínas en más de 12.500 organismos, desde bacterias hasta humanos.

Usos clave de STRING en bioinformática:

  • Análisis de redes proteicas: Visualiza interacciones para identificar módulos funcionales, como vías metabólicas o complejos proteicos.
  • Enriquecimiento de vías y funciones: Detecta si un conjunto de genes/proteínas está enriquecido en procesos biológicos (GO, KEGG), con correcciones FDR mejoradas en la versión 2025.
  • Clustering y anotaciones: Agrupa proteínas por similitud y proporciona anotaciones automáticas, ideal para estudios genómicos y proteómicos.
  • Aplicaciones en IA y ML: Descarga embeddings de redes para modelos de aprendizaje automático, permitiendo transferencias entre especies.
  • Herramientas complementarias: Incluye APIs, descargas y software de escritorio para análisis locales.

Esta versatilidad hace de STRING una herramienta indispensable en investigación en cáncer, farmacología, genómica y más, al combinar datos curados con inteligencia artificial para una curación eficiente.

Casos de Uso Recientes de STRING en Investigación (2024-2025)

La actualización STRING 12.5 ha impulsado su adopción en estudios de vanguardia, especialmente en redes proteicas con direccionalidad para modelar regulación genética. Aquí van ejemplos recientes de aplicaciones de STRING en papers publicados en 2024 y 2025, destacando su rol en bioinformática aplicada:

  • Análisis de toxicidad en cáncer renal (2025): En un estudio sobre el ftalato DEHP y carcinoma de células renales, STRING se usó en farmacología de redes para identificar blancos moleculares y mecanismos tóxicos, integrando interacciones con datos transcriptómicos.
  • Mecanismos en cáncer de tiroides (2025): Investigadores emplearon STRING para elucidar cómo el fosfato Tris(2-butoxyethyl) contribuye al desarrollo tumoral, mapeando redes de proteínas reguladoras y prediciendo progresión vía enriquecimiento de vías.
  • Genes relacionados con ferroptosis en sepsis (2025): STRING facilitó el screening de genes hub en análisis bioinformático, combinado con Cytoscape, para enriquecer funciones GO/KEGG y proponer dianas terapéuticas contra la muerte celular ferroptótica.
  • Validación en leucemia mieloide aguda (2025): Para evaluar la expresión de NUP210 y su pronóstico, STRING validó asociaciones con genes como MEIS1 y HOXAs, integrando datos de ENCORI para redes interactómicas.
  • Efecto protector de fármacos en lesión pulmonar (2024): En modelos de sepsis, STRING apoyó la farmacología de redes para el sufentanilo, identificando vías antiinflamatorias y protegiendo contra daño pulmonar agudo.
  • Integración con IA para variantes genéticas (2025): Predicción de SNPs deletéreos en proteínas, usando STRING para redes de interacciones y herramientas de IA en bioinformática.

Estos casos ilustran cómo STRING acelera descubrimientos en investigación en cáncer, toxicología y enfermedades infecciosas, con énfasis en su nueva red reguladora para modelado predictivo.

Contacto con el Equipo de STRING

Para consultas técnicas, colaboraciones o soporte, el consorcio STRING (liderado por instituciones como EMBL y CPR) ofrece canales directos:

Responden en inglés preferentemente, pero el sitio soporta múltiples idiomas.

URL para Más Información sobre STRING Database

Explora la versión completa en string-db.org, donde encontrarás descargas, tutoriales y la documentación de STRING 12.5. Para papers detallados, consulta el artículo en Nucleic Acids Research (2025).

Continue Reading
Advertisement
Click to comment

Leave a Reply

Tu dirección de correo electrónico no será publicada. Los campos obligatorios están marcados con *

TechSalud

Cómo las células inmunitarias de la sangre aceleran el envejecimiento cerebral y cómo revertirlo

Publicado

on

Introducción: Un avance que cambia la forma de entender el envejecimiento del cerebro

El envejecimiento cerebral y la pérdida de memoria no dependen solo de lo que ocurre dentro del cerebro. Un estudio publicado el 14 de mayo de 2026 en la revista Immunity demuestra que células CD8+ T envejecidas que circulan en la sangre (sin necesidad de infiltrarse masivamente en el tejido cerebral) son un motor clave del deterioro cognitivo.

Este hallazgo, liderado por el neurocientífico Saul A. Villeda de la Universidad de California en San Francisco (UCSF), abre una vía terapéutica mucho más accesible: actuar sobre la sangre en lugar de tener que cruzar la barrera hematoencefálica.

El Estudio Original en Detalle: “Aged circulating CD8+ T cells and their secreted factors drive cognitive decline”

Autores principales: Juliana Sucharov (primera autora), Gregor Bieri y Saul A. Villeda (autor senior). Revista: Immunity (Cell Press) – DOI: 10.1016/j.immuni.2026.04.014. Fecha de publicación: 14 de mayo de 2026.

Metodología clave

Los investigadores utilizaron varios modelos experimentales en ratones:

  • Parabiosis heterocrónica (unir la circulación sanguínea de ratones jóvenes y viejos).
  • Transferencia de células CD8+ aisladas de ratones viejos a ratones jóvenes.
  • Depleción selectiva de CD8+ en ratones viejos con anticuerpos.
  • Bloqueo farmacológico de la granzima K (GZMK), una molécula proinflamatoria que secretan estas células envejecidas.
  • Análisis comportamentales (pruebas de memoria de reconocimiento de objetos, laberintos, etc.).
  • Secuenciación de ARN (bulk y single-nucleus) en el hipocampo.

Hallazgos principales

  1. Las CD8+ viejas circulares son suficientes para dañar la cognición: Ratones jóvenes que recibieron CD8+ de ratones viejos mostraron peor rendimiento en tareas de memoria dependientes del hipocampo.
  2. Mecanismo principal: Estas células mantienen un estado activado “intrínseco” de la edad y secretan altos niveles de granzima K (GZMK). Esta enzima promueve inflamación crónica de bajo grado (inflammaging), altera la plasticidad sináptica y reduce la neurogénesis en el hipocampo.
  3. Intervenciones efectivas:
    • Eliminación de las CD8+ en ratones viejos → mejora cognitiva significativa.
    • Bloqueo de GZMK → efectos rejuvenecedores similares.
    • Los perfiles transcriptómicos del hipocampo de ratones tratados se volvieron más parecidos a los de animales jóvenes.

Importancia práctica: “No es necesario entrar al cerebro para tratar el deterioro cognitivo. Podemos bloquear cosas en la sangre y mejorar la memoria”, destacó Villeda en comentarios a Nature.

Otros Avances Similares del Laboratorio Villeda y el Campo

El trabajo de 2026 es parte de una línea de investigación consolidada sobre comunicación sangre-cerebro en el envejecimiento:

  • 2023 – Factores plaquetarios (PF4 / CXCL4): Administración de factores derivados de plaquetas rejuveneció la neurogénesis hipocampal, redujo inflamación y mejoró cognición en ratones viejos (Nature).
  • Ejercicio como medicina: El ejercicio libera “exerkines” (como Gpld1) que actúan vía sangre protegiendo el cerebro y modulando el sistema inmune.
  • Plasma joven: Transfusiones o fracciones de plasma joven revierten aspectos del envejecimiento cerebral (estudios previos del mismo laboratorio desde 2011-2014).
  • Otros estudios del lab (2025-2026): Targeting de Ftl1 (proteína asociada al hierro) y enzimas hepáticas que protegen la barrera hematoencefálica.

Enfoques relacionados en el campo

  • Senolíticos (Dasatinib + Quercetina – D+Q): Eliminan células senescentes (“zombis”) que contribuyen a la inflamación. Ensayos clínicos fase I/II en Alzheimer temprano (SToMP-AD y otros) muestran buena tolerabilidad y penetración en LCR. Aún se esperan resultados de eficacia a mayor escala.
  • Estudios sobre microglia envejecida y estados intermedios inflamatorios que aceleran el declive cognitivo.

Implicancias para Humanos y Futuro Terapéutico

Aunque el estudio es preclínico (ratones), es altamente traducible porque:

  • Las CD8+ envejecidas y la inflamación crónica también aumentan en humanos con la edad.
  • Actuar en la periferia (sangre) es más seguro y factible que intervenciones directas en el cerebro.
  • Potencial combinación con estilos de vida y otros senolíticos o antiinflamatorios.

Limitaciones actuales: Falta confirmar en primates y humanos. Los tratamientos (anticuerpos o inhibidores de GZMK) aún no están disponibles clínicamente.

Qué Puedes Hacer Hoy: Estrategias Basadas en Evidencia

Mientras avanzan estos tratamientos:

  • Ejercicio aeróbico + fuerza (150 min/semana).
  • Dieta antiinflamatoria (Mediterránea o MIND).
  • Sueño de calidad (7-9 horas).
  • Control de factores de riesgo vascular (presión, glucosa, colesterol).
  • Estimulación cognitiva y vida social activa.

Fuentes y Referencias Detalladas

  1. Sucharov J, et al. (2026). «Aged circulating CD8+ T cells and their secreted factors drive cognitive decline». Immunity. DOI: 10.1016/j.immuni.2026.04.014. Enlace
  2. Nature News (2026). «Immune cells in the blood drive brain ageing». Enlace
  3. Schroer AB, et al. (2023). «Platelet factors attenuate inflammation and rescue cognition in ageing». Nature. DOI: 10.1038/s41586-023-06436-3.
  4. Villeda Lab Publications: villedalab.ucsf.edu/publications
  5. Ensayos senolíticos: Información en ClinicalTrials.gov (SToMP-AD y similares) y revisiones en Alzforum.org.

Continue Reading

TechSalud

Gador inaugura la primera planta de oligonucleótidos terapéuticos en Argentina y latam

Publicado

on

El laboratorio nacional Gador ha marcado un antes y un después en la industria farmacéutica argentina y regional al inaugurar la primera planta de oligonucleótidos terapéuticos sintéticos de Argentina y América Latina. Ubicada en el Parque Industrial Pilar, provincia de Buenos Aires, esta nueva infraestructura representa un avance tecnológico clave para producir terapias de última generación que actúan directamente sobre el origen molecular de diversas enfermedades.

Inversión y capacidad productiva

La planta demandó una inversión de 21,5 millones de dólares y permitirá fabricar en el país medicamentos innovadores de alta complejidad. Con esta iniciativa, Gador no solo fortalece la soberanía sanitaria nacional, sino que también proyecta exportar una importante porción de su producción, posicionando a Argentina como referente regional en biotecnología farmacéutica.

Primer medicamento nacional para la Atrofia Muscular Espinal (AME)

Gracias a esta nueva planta, Gador ya produce la primera especialidad medicinal nacional basada en oligonucleótidos para el tratamiento de la Atrofia Muscular Espinal (AME), una enfermedad neuromuscular genética poco frecuente que afecta principalmente a niños y adolescentes.

Este tratamiento, desarrollado bajo los más altos estándares internacionales de calidad e innovación, ayuda a ralentizar el avance de la enfermedad, mejora significativamente la función motora y respiratoria, y eleva la calidad y expectativa de vida de los pacientes. Su incorporación al sistema público de salud representa un gran paso en equidad y acceso: se ofrece a un precio cercano al 50% inferior al del producto innovador original, lo que garantiza mayor disponibilidad para quienes más lo necesitan.

¿Qué son los oligonucleótidos terapéuticos y cómo funcionan?

Los oligonucleótidos terapéuticos constituyen una nueva generación de medicamentos de medicina de precisión. A diferencia de los tratamientos tradicionales que suelen abordar síntomas, estos actúan de forma altamente selectiva a nivel molecular.

  • Están formados por cadenas cortas de nucleótidos dispuestos en una secuencia específica.
  • Actúan sobre el ARN (el mensajero que transporta la información genética dentro de las células), permitiendo corregir o bloquear las señales que causan enfermedades sin modificar el ADN del paciente.
  • Su síntesis se realiza mediante un proceso químico controlado sobre un soporte sólido, incorporando nucleótidos uno a uno con alta precisión.

Esta tecnología integra diseño molecular, biología avanzada y producción de vanguardia, consolidándose como uno de los pilares de la medicina personalizada a nivel global.

Impacto en la salud y la industria

La puesta en marcha de esta planta no solo amplía el acceso a terapias de alta complejidad para enfermedades poco frecuentes, sino que también impulsa el desarrollo científico-tecnológico local, genera empleo calificado y reduce la dependencia de importaciones en un segmento estratégico de la salud.

Gador reafirma así su compromiso con la innovación y el cuidado de la vida, consolidando su rol como uno de los laboratorios líderes de Argentina con una plataforma industrial de excelencia.


Fuentes consultadas:

Continue Reading

TechSalud

Virus oncolíticos: análisis técnico del desarrollo argentino y su impacto en la terapéutica contra el cáncer

Publicado

on

La viroterapia oncolítica representa una de las estrategias más sofisticadas dentro de la inmunooncología contemporánea. Consiste en el uso de virus modificados genéticamente para infectar, replicarse y destruir selectivamente células tumorales, al tiempo que inducen una respuesta inmune antitumoral sistémica. En los últimos años, Argentina ha emergido como un actor relevante en este campo a partir del desarrollo de plataformas virales innovadoras, destacándose el caso de Unleash Immuno Oncolytics, fundada por el científico Daniel Katzman, cuyo trabajo se basa en décadas de investigación previa en instituciones como la Fundación Instituto Leloir y el CONICET.

Desde el punto de vista molecular, los virus oncolíticos se diseñan para explotar vulnerabilidades específicas de las células tumorales, tales como defectos en las vías de respuesta antiviral, alteraciones en los mecanismos de control del ciclo celular o la sobreexpresión de receptores de superficie. Los vectores más comúnmente utilizados incluyen adenovirus, virus del herpes simple (HSV), reovirus y vaccinia, los cuales son modificados mediante ingeniería genética para restringir su tropismo a células malignas. Estas modificaciones pueden implicar la deleción de genes virales esenciales para la replicación en células normales, o la inserción de promotores específicos activos únicamente en el contexto tumoral. En el caso de los desarrollos argentinos, gran parte de la investigación ha girado en torno a adenovirus recombinantes capaces de replicarse preferentemente en células cancerígenas, optimizando así el índice terapéutico.

El mecanismo de acción de estos virus es multifactorial. En primer lugar, la infección selectiva permite que el virus ingrese a la célula tumoral mediante interacciones con receptores específicos. Una vez dentro, el virus utiliza la maquinaria celular para replicarse, acumulando partículas virales hasta provocar la lisis celular. Este proceso libera nuevas unidades virales que pueden infectar células tumorales adyacentes, generando un efecto de amplificación local. Sin embargo, el aspecto más relevante desde el punto de vista clínico es la inducción de inmunidad antitumoral. La lisis celular libera antígenos tumorales junto con señales de peligro (DAMPs y PAMPs), lo que promueve la activación de células dendríticas y la presentación antigénica a linfocitos T. De este modo, se desencadena una respuesta inmune adaptativa capaz de reconocer y atacar células tumorales incluso en sitios distantes, fenómeno conocido como efecto abscopal.

Los desarrollos liderados por el investigador Osvaldo Podhajcer han sido particularmente influyentes en este campo. Su equipo logró diseñar virus oncolíticos con capacidad no solo de destruir células tumorales, sino también de modular el microambiente tumoral, un componente clave en la progresión del cáncer. El microambiente tumoral suele caracterizarse por inmunosupresión, hipoxia y una matriz extracelular densa que dificulta la penetración de terapias. Los virus diseñados en estos proyectos incorporan estrategias para revertir estas condiciones, incluyendo la expresión de citoquinas proinflamatorias o enzimas que degradan la matriz extracelular, mejorando así la infiltración de células inmunes.

El paso desde la investigación básica hacia la aplicación clínica ha sido facilitado por la transferencia tecnológica hacia empresas como Unleash Immuno Oncolytics. Esta compañía logró estructurar una plataforma basada en virus oncolíticos que posteriormente fue licenciada a la empresa estadounidense TransCode Therapeutics, lo que constituye un ejemplo significativo de valorización de ciencia desarrollada en América Latina. Este tipo de acuerdos permite escalar la investigación hacia fases clínicas, donde se evalúan parámetros críticos como seguridad, biodistribución, dosis óptima y eficacia terapéutica en humanos.

A nivel global, la viroterapia oncolítica ya ha alcanzado hitos regulatorios importantes. El caso más emblemático es el de T-VEC (talimogene laherparepvec), un virus del herpes simple modificado aprobado para el tratamiento de melanoma avanzado. Este antecedente valida el concepto terapéutico, aunque también evidencia las limitaciones actuales. Entre los principales desafíos se encuentran la neutralización del virus por el sistema inmune antes de alcanzar el tumor, la heterogeneidad tumoral que limita la eficacia en distintos tipos de cáncer y la necesidad de combinar estas terapias con otras modalidades, como inhibidores de puntos de control inmunológico.

En el contexto argentino, investigaciones adicionales han explorado el uso de virus derivados de adenovirus para tratar cáncer colorrectal, incluyendo variantes resistentes a quimioterapia. Estos estudios sugieren que los virus oncolíticos pueden ser particularmente útiles en tumores refractarios, donde las opciones terapéuticas convencionales son limitadas. Asimismo, se ha observado que la combinación con inmunoterapias puede potenciar significativamente la respuesta, lo que posiciona a los virus oncolíticos como componentes de estrategias terapéuticas multimodales.

Desde una perspectiva regulatoria y translacional, el desarrollo de estas terapias enfrenta múltiples desafíos. Los ensayos clínicos deben demostrar no solo eficacia, sino también un perfil de seguridad adecuado, especialmente considerando que se trata de agentes replicativos. Además, la producción a escala industrial requiere cumplir con estándares estrictos de calidad y bioseguridad. En este sentido, la colaboración internacional resulta fundamental para avanzar hacia la aprobación regulatoria en mercados como Estados Unidos y Europa.

En términos de proyección, se estima que varios candidatos basados en virus oncolíticos podrían alcanzar fases clínicas avanzadas en los próximos años, aunque el proceso completo hasta su aprobación puede extenderse más allá de una década. No obstante, el potencial disruptivo de esta tecnología es considerable. A diferencia de la quimioterapia tradicional, que afecta tanto células sanas como malignas, los virus oncolíticos ofrecen un enfoque altamente selectivo, con la capacidad adicional de transformar tumores inmunológicamente “fríos” en “calientes”, es decir, susceptibles a ser atacados por el sistema inmune.

En conclusión, el desarrollo de virus que “cazan tumores” constituye una convergencia entre biología molecular, ingeniería genética e inmunología aplicada. Argentina ha logrado insertarse en este campo mediante contribuciones científicas de alto nivel y su posterior transferencia al sector productivo. Si bien aún se trata de una tecnología en desarrollo, su evolución podría redefinir el tratamiento del cáncer en las próximas décadas, especialmente en combinación con otras terapias avanzadas.


Fuentes

Continue Reading

TENDENCIAS